O jogo começa em circunstâncias misteriosas, onde o personagem principal John Carver se encontra amarrado a uma cadeira na barriga vazia e enferrujada de um navio de carga decrépito. Graças à ajuda de um estranho invisível, as restrições de John são afrouxadas e ele sai para escapar de seus captores. Deste ponto em diante, você está no controle do destino de John. Far Cry oferece uma variedade de maneiras de abordar cada situação desafiadora, onde os jogadores podem optar por confiar no poder de fogo, estratégia e furtividade.