O próximo capítulo da série Rainbow Six apresenta uma nova experiência para um jogador com equipamentos avançados e novos enredos. Desta vez, você pode jogar como Ding Chavez (o líder do Time Rainbow) ou Dieter Weber (um franco-atirador encarregado de cobrir o movimento de seu time). Você deve liderar sua unidade contraterrorista em território desconhecido para combater uma ameaça bioterrorista. Rainbow Six 3 também apresenta modos multiplayer online, incluindo o modo de rivalidade exclusivo para PS2 e o modo de carreira exclusivo para Xbox.